一、公司定位:专注机制导向抗癌 / 抗感染药物研发的合同研究组织
您是否需要对新型药物、化合物或天然产物针对拓扑异构酶的潜在作用进行高度详细且可靠的评估?我们可以提供帮助!
作为拓扑异构酶研究领域经验超过 20 年的合同研究组织(CRO),TopoGEN 能快速交付清晰、可用于发表的实验数据。我们将严格的实验分析(仅使用纯拓扑异构酶,绝不使用提取物)与战略见解相结合,助力您揭示化合物的作用机制。我们的定价会根据您的项目需求定制,且所有实验均包含阳性对照和阴性对照,不额外收费。我们承诺对实验结果严格保密,并确保您拥有完整的数据所有权。从实验设计到深度报告撰写,我们始终是您的合作伙伴,助力您高效、经济地实现具有发表价值的重要研究突破。
二、公司核心优势
1.可靠专业实力:在拓扑异构酶靶向研究领域拥有 20 余年经验,具备体外及体内实验经验,是该领域的合同研究组织。
2.可发表级结果:实验数据清晰规范,包含严格的阳性对照与阴性对照,确保结果可直接用于学术发表。
3.高性价比与定制化服务:定价具有竞争力,且会根据您的具体项目需求调整;后续服务还可享受折扣优惠。
4.战略支持:不仅提供检测服务,还协助您进行实验设计、数据分析及后续规划,最终交付完整且归您所有的数据资料包。
5.快速交付与绝对保密:实验周期高效,确保您拥有完整的数据所有权,并可通过签署保密协议(NDA)保护您的知识产权。
三、清晰明确的实验结果
我们的实验数据将为您规划特定测试药物的后续研发阶段提供有价值的参考,且我们保证实验结果清晰明确。若结果不理想,我们将自费重复实验,直至获得明确结果。
我们采用多层级测试方法,帮您节省时间与人力成本。该方法能快速评估药物对靶点的潜在作用:
•若结果明确为阴性,则无需后续实验;
•若检测到阳性结果,我们将与您密切合作,设计合理的后续实验步骤,以揭示作用机制细节(如界面毒物 IFP 或催化抑制化合物 CIC,详见下文说明),且后续研究可享受折扣。
•无论何种情况,若实验结果不明确,我们将免费重复分析,直至结果清晰无误。
四、拓扑异构酶靶向药物背景知识
拓扑异构酶是的有效抗癌药物靶点,同时也是抗感染(抗生素)药物的重要靶点。如果您研发的天然产物、合成化合物或半合成化合物能作用于拓扑异构酶通路(无论是拓扑异构酶本身,还是该通路中的其他环节),那么这种新型化合物在临床上发挥疗效的可能很高。当然,也存在一些限制因素,因为体内生理过程及独特的药代动力学特性可能会影响其临床疗效。尽管如此,初步证实化合物与拓扑异构酶存在特异性相互作用,仍是关于该化学物质重要且有价值的信息。
拓扑异构酶靶向药物主要通过两种已明确的机制发挥作用,这两种机制通常具有不同的作用模式,但也可能存在共性。
(1)机制一:高度特异性的 “界面毒物"(IFP)
这是一种抑制作用,主要发生在拓扑异构酶与 DNA 发生协同切割和重新连接的过程中。关键在于,所有拓扑异构酶共有的切割 - 重新连接过程可视为切割状态与连接状态之间的平衡反应,其形式如下:
DNA / 拓扑异构酶→切割 DNA→DNA 完整性:连接状态
拓扑异构酶以搜索模式结合 DNA(主要通过离子键、静电力或氢键作用,详见质量作用平衡左侧),也就是说,这并非共价相互作用。一旦酶结合到合适的切割位点,切割反应随即发生(红色方框标注),随后立即发生拓扑结构转换(或连接数调整)。需要注意的是,切割反应发生后,DNA 底物与拓扑异构酶分子之间会形成共价键。切割中间体的存在时间极短,而作为协同步骤的快速重新连接对维持 DNA 完整性至关重要。
界面毒物(IFP)会使上述平衡向右侧移动(大箭头所示),从而更易形成切割复合物(此时 DNA 底物与拓扑异构酶分子间形成共价键)。典型的界面毒物(IFP)会推动平衡向右侧移动,进而促进切割 DNA 中间体的形成。
(2)机制二:催化抑制化合物(CIC)
部分药物可归为催化抑制化合物(CIC)。这类药物的特异性通常较低,主要作用是抑制拓扑异构酶的活性。ATP 酶抑制剂以及部分嵌入剂都属于催化抑制化合物(CIC)。
五、服务支持
TopoGEN 的工作人员将与您或您的团队紧密合作,设计最佳的实验筛选方案,以识别潜在的界面毒物(IFP)、催化抑制化合物(CIC)或同时识别两者。项目完成后,我们将继续提供服务、咨询建议及项目支持。
我们与客户的合作关系不会随着项目报告的交付而终止。在所有项目中,我们都会与客户共同制定合理的 “后续计划"。此外,由于我们设计的筛选方案能够揭示阳性结果化合物的细微作用机制,因此通常只需少数关键实验就能明确其作用机制(MOA)。具体而言,我们设计的实验可在同一组反应中同时识别催化抑制剂和界面毒物(详见第 3 页 “实用背景知识" 部分),这意味着很高的成本效益。
由于我们会将实验结果与已知的拓扑异构酶药物(作为阳性对照)进行交叉比对,因此能获得关于药物作用机制的高度有意义的详细信息。
为确保科学严谨性,我们会采取措施验证每个实验内部结果的一致性。例如,作为内部质量控制测试,我们通常会用喜树碱(CPT)和依托泊苷(VP16)对拓扑异构酶 II 进行测试,以证明界面毒物(IFP)对前者具有特异性。
通常情况下,除非存在界面毒物(IFP),否则拓扑异构酶无法导致 DNA 性断裂,但也存在一些例外情况。若实验中拓扑异构酶与 DNA 的比例很高,即使没有界面毒物(IFP),也可能观察到一定程度的 DNA 断裂。凭借丰富的经验和专业知识,我们设计的筛选方案会特别注意避免这种潜在问题。例如,当人体拓扑异构酶 I 蛋白输入量很高时,可能会检测到不依赖于界面毒物(IFP)的切割反应;同样,当大肠杆菌 DNA 促旋酶的用量达到化学计量过量时,即使没有已知的界面毒物(如环丙沙星等氟喹诺酮类药物),也可能诱导 DNA 双链断裂。
在多数情况下,我们了解到您的化合物会溶解在通用溶剂(如二甲基亚砜 DMSO)中。高浓度 DMSO 的使用存在风险,可能导致假阳性结果,但在我们的筛选实验中绝不会出现这种情况,原因如下:
1.我们会针对每一批酶确定 DMSO 的使用上限;
2.我们会设置对照实验,排除溶剂本身对实验结果的影响。
六、成本效益分析
假设您正面临一个决策:针对单一化合物的筛选,是选择在内部实验室进行,还是与我们合作?由于全球范围内的人力成本及其他无形成本差异较大,很难一概而论,但我们可以提供一个大致的对比参考。
单一化合物针对Top I或 2的筛选
我们估算,在内部实验室对单一化合物进行Top I或 Top2的筛选,仅材料、耗材和人力成本就会超过 4000 美元。这一费用涵盖了材料耗材、人力、多套筛选bob星空体育、对照药物、相关标记物、酶、不稳定产品的干冰运输、bob星空体育的常温运输以及各种关税等(仅列举部分项目)。此外,这一估算还基于所有实验一次成功,且您的团队能获得符合期刊同行评审或UPTO高标准证据要求的规范数据。
根据我们的经验,一般研究人员往往需要投入大量额外人力来建立实验方法,这会增加成本,且无法保证实验成功。而 TopoGEN 提供的筛选服务,不仅成本约为内部实验的一半,耗时也大幅缩短,还能确保交付清晰、可用于发表的实验成果。您将获得由专业人员出具的详细实验数据,他们具备丰富的常规操作经验。我们的筛选项目已被证明具有很的成本效益,能助力您的科研工作快速推进,同时节省科研经费。我们通常能在几个工作日内完成此类研究,并保证实验结果符合要求。
六、灵活高效的筛选项目
我们的筛选项目提供快速交付服务,兼具成本效益与灵活性!
如果您需要定期研发新型药物,可咨询批量筛选服务。您可以预先确定一定数量的测试药物,在符合您日程安排的时间段内享受优惠价格。我们将与您的化学团队或工作人员协作,对新合成的化合物进行测试。通过这种方式,您既能享受批量筛选合同的价格优势(针对多种化合物),又能在时间安排和测试控制方面拥有灵活性,从而与您的项目进度匹配,实现高成本效益。
虽然您可以使用我们的特色产品在内部进行筛选,但这并非总是切实可行的方案。针对两种拓扑异构酶靶点对一种药物进行筛选,内部实验成本会超过 4000 美元,且无法保证获得可用于发表的实验成果。这其中很大一部分成本源于实验方法的学习和掌握过程。
七、实时数据支持
当您将药物筛选工作外包给 TopoGEN 时,我们首先会与您沟通,为项目设计最佳的实验方案。若您关注特定靶点,我们会了解您是否需要识别界面毒物(IFP)、催化抑制化合物(CIC)或同时识别两者。我们会为您提供真实的实验数据示例,让您清晰了解最终将获得的实验成果;同时,我们还会告知您完成研究所需的实际工作日(即交付周期)。
图1:展示了针对未知测试药物 A 和 B 进行的ToPO I靶向筛选的实际结果。在该筛选实验中,我们明确证实药物 B 是一种新型ToPO I 界面毒物(IFP)药物。
注:图1、ToPO I 药物筛选实验
采用超螺旋(SC)pHOT1 质粒 DNA(一种专为拓扑异构酶 I 筛选设计的专有底物)进行基于质粒的松弛实验。实验在不同浓度的测试药物 A 和 B(各泳道上方标注了微摩尔浓度)存在或不存在的条件下进行。将反应产物和标记物上样至含有溴化乙锭的琼脂糖凝胶中,该凝胶系统能清晰分离拓扑异构酶 I 切割中间体(缺口开环 DNA,红色三角形标注)。这种切割中间体仅在界面毒物(IFP)存在时才能检测到。
已知的拓扑异构酶 I 界面毒物(IFP)—— 喜树碱(10 微摩尔)作为阳性对照,其泳道中可观察到切割产物的积累(对比含有喜树碱的泳道 4 和不含药物的泳道 6)。测试药物 A 对 pHOT1 DNA 的松弛过程无影响(泳道 7 - 9 与无药物对照泳道 6 对比)。相反,药物 B 明显是一种拓扑异构酶 I 界面毒物(IFP),缺口开环 pHOT1 DNA 的出现(红色三角形标注)可证实这一点,且这些切割产物的产生具有明显的药物浓度依赖性。
值得注意的是,喜树碱阳性对照(泳道 4)表明实验系统运行正常,这让您有理由相信阴性结果(泳道 7 - 9)的可靠性。
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TG2005H-RC3 | HumanTopoisomeraseI | 3000U | TopoGEN |
TG1018-1A | Topoisomerase I Drug Screening Kit | 100 Assays | TopoGEN |
TG2000G-1KIT | PurifiedE.coliDNAGyraseandRelaxedDNAAssayKit(50ugRelaxedDNA+100uGyrase) | 100assays | TopoGEN |
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TG2005H-Y723F | Mutant Human Topoisomerase I (Y723F) | 10ug | TopoGEN |
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TG2004H-1 | HumanTDP1Protein | 250U | TopoGEN |
TG1018-2 | Topoisomerase I Drug Screening Kit | 250 Assays | TopoGEN |
TG2003H-1 | Human TDP-2 | 25ug | TopoGEN |
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DR3000ACustom-Sce | Customer makes own cell line hosting HR Reporter (I-Sce Transfectn req.) No HRHeLa cell line control (50ug DNA) | 25 Assays | TopoGEN |
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TG2038-1 | Human TDP2 DNA Substrate | 10ug | TopoGEN |
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TG4110 | Camptothecin 10mM | 0.25ml | TopoGEN |
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